Стеклопакеты подразумевается пластиковые окна? По сути деревянные окна сейчас делают по тем же технологиям, что и пластиковые. То есть получается тот же стеклопакет, только рама не пластиковая, а деревянная. Дерево всегда лучше: оно не выделяет вредных веществ, оно дышит, обеспечивает комфортный микроклимат в помещении. Шумоизоляция, теплоизоляция у таких окон у деревянных и пластиковых абсолютно одинаковая. Но различается цена. Деревянные окна стоят дороже раза в 2. Если речь об обычных деревянных окнах, то с ними всегда проблема в межсезонье: ссыхаются, разбухают и снова всё по кругу. На зиму их нужно утеплять, периодически красить.